将年终奖并入综合所得计税时，先合并工资薪金、劳务报酬等收入，减除6万元、专项扣除、专项附加扣除等后得出应纳税所得额；再根据年度综合所得税率表确定适用税率和速算扣除数；接着计算全年应纳税额=应纳税所得额×税率-速算扣除数；最后对比已预缴税款，多退少补。居民个人每年仅可选择一次此方式。
如果您在年度汇算清缴时选择将年终奖并入综合所得计算个税，那么您的奖金将与工资薪金、劳务报酬等其他综合所得合并计税。以下是具体的计算方法和操作步骤：
一、确定应纳税所得额
将全年一次性奖金与当年的工资薪金、劳务报酬、稿酬、特许权使用费等四项综合所得合并，计算收入总额。在此基础上，减去每年6万元的基本减除费用、个人承担的“三险一金”等专项扣除、符合条件的子女教育、赡养老人、住房利息等专项附加扣除，以及依法确定的其他扣除项目，得出年度综合应纳税所得额。
1、收集全年工资薪金收入数据，包括每月税前工资及已预扣税款记录。
2、汇总全年取得的劳务报酬、稿酬、特许权使用费等其他综合所得，并按税法规定换算为收入额（如劳务报酬收入≤4000元的减除800元，＞4000元的减除20%）。
3、将上述所有收入加总，得到综合所得收入总额。
4、从收入总额中依次减去60000元基本减除费用、全年“三险一金”个人缴纳部分、已申报的专项附加扣除总额及其他依法扣除项。
应纳税所得额 = 综合所得收入总额 – 60000元 – 专项扣除 – 专项附加扣除 – 其他依法扣除
二、查找适用税率和速算扣除数
根据上一步计算出的年度应纳税所得额，对照《年度综合所得适用税率表》确定对应的税率和速算扣除数。该税率表分为七档，最低税率为3%，最高为45%。所得额越高，适用税率也相应提高。
1、查阅国家税务总局发布的最新年度综合所得税率表。
2、找到您应纳税所得额所处的区间，例如不超过36000元的部分税率为3%，超过960000元至1200000元的部分税率为45%。
3、记录对应区间的税率和速算扣除数，用于下一步计算。
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务必确认使用的是年度税率表而非月度税率表
三、计算应纳税额
在确定适用税率和速算扣除数后，即可计算全年应缴纳的个人所得税总额。此金额包含工资薪金、劳务报酬及年终奖等所有综合所得的税款。
1、将应纳税所得额乘以适用税率。
2、从上述结果中减去对应的速算扣除数。
应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 – 速算扣除数
四、进行税款结算
计算出全年应纳税总额后，需与单位或平台已预扣预缴的税款进行比对，确定最终是需要补税还是可以申请退税。
1、汇总全年由各支付方代扣代缴的个人所得税总额。
2、用第三步计算出的应纳税额减去已预缴税额。
3、若结果为正数，则需在汇算期内补缴相应税款；若为负数，则可申请退还多缴税款。
居民个人在一个纳税年度内只能选择一次将全年一次性奖金并入综合所得计税
